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    PDB 1dgb-1dry
    PDB 1ds1-1e08
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    PDB 1ehk-1f5o
    PDB 1f5p-1fnp
    PDB 1fnq-1fzi
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    PDB 1h44-1hdb
    PDB 1hds-1i5u
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    PDB 1k2r-1kw6
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    PDB 2r1k-2spm
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    PDB 2xj6-2ylj
    PDB 2yrs-2zon
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    PDB 3aet-3bnd
    PDB 3bne-3cir
    PDB 3ciu-3dax
    PDB 3dbg-3e1p
    PDB 3e1q-3eh4
    PDB 3eh5-3fll
    PDB 3fm1-3gas
    PDB 3gb4-3h57
    PDB 3h58-3hrw
    PDB 3hsn-3ir6
    PDB 3ir7-3k9y
    PDB 3k9z-3l4p
    PDB 3l61-3lxi
    PDB 3lyq-3mm8
    PDB 3mm9-3n62
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    PDB 3nlp-3o0f
    PDB 3o0r-3p6o
    PDB 3p6p-3prq
    PDB 3prr-3sel
    PDB 3sik-3una
    PDB 3unc-4blc
    PDB 4cat-4erg
    PDB 4erm-4nse
    PDB 4pah-8cat
    PDB 8cpp-9nse

Iron in the structure of Solution Structure of Desulfovibrio Vulgaris (Hildenborough) Ferrocytochrome C3, uc(Nmr), 20 Structures (pdb 1a2i)






The binding sites of Iron atom in the structure of Solution Structure of Desulfovibrio Vulgaris (Hildenborough) Ferrocytochrome C3, uc(Nmr), 20 Structures (pdb code 1a2i). This binding sites where shown with 5.0 Angstroms radius around Iron atom.
The 1a2i structure was solved by A.C.MESSIAS, D.H.K.KASTRAU, H.S.COSTA, J.LEGALL, D.L.TURNER, H.SANTOS, A.V.XAVIER, with NMR in Solution technique.


Iron Binding Sites:

Iron binding site 1 out of 4 in 1a2i


Iron binding site 1 out of 4 in 1a2i
Click to enlarge
stereopicture of Iron binding site 1 out of 4 in 1a2i
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Mono- and Stereo- picture of 5.0 Angstrom coordination sphere 1 of Iron in the PDB 1a2i. Coordination sphere was calculated for all residues within 5.0 Angstroms distance from the central Iron atom, shown by VdW sphere
Residues shown as a stick model or VDW spheres: A: Pro5, A: Phe20, A: His22, A: Cys33, A: His34, A: Tyr43, A: Hec108, A: Hec109, A: Pro5, A: Phe20, A: His22, A: Cys33, A: His34, A: Hec108, A: Hec109, A: Pro5, A: Phe20, A: His22, A: Cys33, A: His34, A: Tyr43, A: Hec108, A: Hec109, A: Pro5, A: Phe20, A: His22, A: Cys33, A: His34, A: Tyr43, A: Hec108, A: Hec109, A: Pro5, A: Phe20, A: His22, A: Cys33, A: His34, A: Hec108, A: Hec109, A: Pro5, A: Phe20, A: His22, A: Cys33, A: His34, A: Tyr43, A: Hec108, A: Hec109, A: Pro5, A: Phe20, A: His22, A: Cys33, A: His34, A: Tyr43, A: Hec108, A: Hec109, A: Pro5, A: Phe20, A: His22, A: Cys33, A: His34, A: Tyr43, A: Hec108, A: Hec109, A: Pro5, A: Phe20, A: His22, A: Cys33, A: His34, A: Tyr43, A: Hec108, A: Hec109, A: Pro5, A: Phe20, A: His22, A: Cys33, A: His34, A: Tyr43, A: Hec108, A: Hec109, A: Ala4, A: Pro5, A: Phe20, A: His22, A: Cys33, A: His34, A: Tyr43, A: Hec108, A: Pro5, A: Phe20, A: His22, A: Cys33, A: His34, A: Hec108, A: Hec109, A: Pro5, A: Phe20, A: His22, A: Cys33, A: His34, A: Tyr43, A: Hec108, A: Hec109, A: Pro5, A: Phe20, A: His22, A: Cys33, A: His34, A: Tyr43, A: Hec108, A: Hec109, A: Pro5, A: Phe20, A: His22, A: Cys33, A: His34, A: Hec108, A: Hec109, A: Pro5, A: Phe20, A: His22, A: Cys33, A: His34, A: Tyr43, A: Hec108, A: Hec109, A: Pro5, A: Phe20, A: His22, A: Cys33, A: His34, A: Tyr43, A: Hec108, A: Hec109, A: Pro5, A: Phe20, A: His22, A: Cys33, A: His34, A: Hec108, A: Hec109, A: Pro5, A: Phe20, A: His22, A: Cys33, A: His34, A: Tyr43, A: Hec108, A: Hec109, A: Pro5, A: Phe20, A: His22, A: Cys33, A: His34, A: Tyr43, A: Hec108, A: Hec109,

conact list:


AtomAtomDistance (A)
FeHG3 A:Pro54.98
FeCD A:Pro54.95
FeHD2 A:Pro54.51
FeHD3 A:Pro54.52
FeCE2 A:Phe204.68
FeHE2 A:Phe203.77
FeCD2 A:His222.93
FeHD1 A:His224.95
FeCG A:His224.07
FeHD2 A:His223.19
FeNE2 A:His221.93
FeHE1 A:His223.18
FeND1 A:His224.04
FeCE1 A:His222.93
FeHB2 A:Cys334.98
FeCD2 A:His342.94
FeHD1 A:His344.95
FeCG A:His344.08
FeHD2 A:His343.22
FeNE2 A:His341.94
FeHE1 A:His343.16
FeND1 A:His344.04
FeCE1 A:His342.92
FeHB3 A:Tyr434.94
FeC2D A:Hec1084.28
FeNA A:Hec1082.01
FeCHA A:Hec1083.44
FeC2A A:Hec1084.29
FeC1D A:Hec1083.06
FeC4A A:Hec1083.06
FeC4B A:Hec1083.06
FeC3A A:Hec1084.29
FeHHA A:Hec1084.53
FeC1C A:Hec1083.06
FeC2C A:Hec1084.29
FeNB A:Hec1082.02
FeHHC A:Hec1084.54
FeFE A:Hec1080.00
FeC3B A:Hec1084.29
FeC4D A:Hec1083.06
FeNC A:Hec1082.02
FeCHB A:Hec1083.45
FeCHC A:Hec1083.45
FeC3D A:Hec1084.28
FeC4C A:Hec1083.06
FeC2B A:Hec1084.29
FeHHB A:Hec1084.54
FeND A:Hec1082.02
FeCHD A:Hec1083.45
FeC1B A:Hec1083.06
FeHHD A:Hec1084.54
FeC3C A:Hec1084.29
FeC1A A:Hec1083.06
FeHBB3 A:Hec1094.58
FeHG3 A:Pro54.98
FeCD A:Pro54.95
FeHD2 A:Pro54.51
FeHD3 A:Pro54.52
FeCE2 A:Phe204.68
FeHE2 A:Phe203.77
FeCD2 A:His222.93
FeHD1 A:His224.95
FeCG A:His224.07
FeHD2 A:His223.19
FeNE2 A:His221.93
FeHE1 A:His223.18
FeND1 A:His224.04
FeCE1 A:His222.93
FeHB2 A:Cys334.98
FeCD2 A:His342.94
FeHD1 A:His344.95
FeCG A:His344.08
FeHD2 A:His343.22
FeNE2 A:His341.94
FeHE1 A:His343.16
FeND1 A:His344.04
FeCE1 A:His342.92
FeC2D A:Hec1084.28
FeNA A:Hec1082.01
FeCHA A:Hec1083.44
FeC2A A:Hec1084.29
FeC1D A:Hec1083.06
FeC4A A:Hec1083.06
FeC4B A:Hec1083.06
FeC3A A:Hec1084.29
FeHHA A:Hec1084.53
FeC1C A:Hec1083.06
FeC2C A:Hec1084.29
FeNB A:Hec1082.02
FeHHC A:Hec1084.54
FeFE A:Hec1080.00
FeC3B A:Hec1084.29
FeC4D A:Hec1083.06
FeNC A:Hec1082.02
FeCHB A:Hec1083.45
FeCHC A:Hec1083.45
FeC3D A:Hec1084.28
FeC4C A:Hec1083.06
FeC2B A:Hec1084.29
FeHHB A:Hec1084.54
FeND A:Hec1082.02
FeCHD A:Hec1083.45
FeC1B A:Hec1083.06
FeHHD A:Hec1084.54
FeC3C A:Hec1084.29
FeC1A A:Hec1083.06
FeHBB3 A:Hec1094.58
FeHG3 A:Pro54.98
FeCD A:Pro54.95
FeHD2 A:Pro54.51
FeHD3 A:Pro54.52
FeCE2 A:Phe204.68
FeHE2 A:Phe203.77
FeCD2 A:His222.93
FeHD1 A:His224.95
FeCG A:His224.07
FeHD2 A:His223.19
FeNE2 A:His221.93
FeHE1 A:His223.18
FeND1 A:His224.04
FeCE1 A:His222.93
FeHB2 A:Cys334.98
FeCD2 A:His342.94
FeHD1 A:His344.95
FeCG A:His344.08
FeHD2 A:His343.22
FeNE2 A:His341.94
FeHE1 A:His343.16
FeND1 A:His344.04
FeCE1 A:His342.92
FeHB3 A:Tyr434.94
FeC2D A:Hec1084.28
FeNA A:Hec1082.01
FeCHA A:Hec1083.44
FeC2A A:Hec1084.29
FeC1D A:Hec1083.06
FeC4A A:Hec1083.06
FeC4B A:Hec1083.06
FeC3A A:Hec1084.29
FeHHA A:Hec1084.53
FeC1C A:Hec1083.06
FeC2C A:Hec1084.29
FeNB A:Hec1082.02
FeHHC A:Hec1084.54
FeFE A:Hec1080.00
FeC3B A:Hec1084.29
FeC4D A:Hec1083.06
FeNC A:Hec1082.02
FeCHB A:Hec1083.45
FeCHC A:Hec1083.45
FeC3D A:Hec1084.28
FeC4C A:Hec1083.06
FeC2B A:Hec1084.29
FeHHB A:Hec1084.54
FeND A:Hec1082.02
FeCHD A:Hec1083.45
FeC1B A:Hec1083.06
FeHHD A:Hec1084.54
FeC3C A:Hec1084.29
FeC1A A:Hec1083.06
FeHBB3 A:Hec1094.58
FeHG3 A:Pro54.98
FeCD A:Pro54.95
FeHD2 A:Pro54.51
FeHD3 A:Pro54.52
FeCE2 A:Phe204.68
FeHE2 A:Phe203.77
FeCD2 A:His222.93
FeHD1 A:His224.95
FeCG A:His224.07
FeHD2 A:His223.19
FeNE2 A:His221.93
FeHE1 A:His223.18
FeND1 A:His224.04
FeCE1 A:His222.93
FeHB2 A:Cys334.98
FeCD2 A:His342.94
FeHD1 A:His344.95
FeCG A:His344.08
FeHD2 A:His343.22
FeNE2 A:His341.94
FeHE1 A:His343.16
FeND1 A:His344.04
FeCE1 A:His342.92
FeHB3 A:Tyr434.94
FeC2D A:Hec1084.28
FeNA A:Hec1082.01
FeCHA A:Hec1083.44
FeC2A A:Hec1084.29
FeC1D A:Hec1083.06
FeC4A A:Hec1083.06
FeC4B A:Hec1083.06
FeC3A A:Hec1084.29
FeHHA A:Hec1084.53
FeC1C A:Hec1083.06
FeC2C A:Hec1084.29
FeNB A:Hec1082.02
FeHHC A:Hec1084.54
FeFE A:Hec1080.00
FeC3B A:Hec1084.29
FeC4D A:Hec1083.06
FeNC A:Hec1082.02
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FeCHC A:Hec1083.45
FeC3D A:Hec1084.28
FeC4C A:Hec1083.06
FeC2B A:Hec1084.29
FeHHB A:Hec1084.54
FeND A:Hec1082.02
FeCHD A:Hec1083.45
FeC1B A:Hec1083.06
FeHHD A:Hec1084.54
FeC3C A:Hec1084.29
FeC1A A:Hec1083.06
FeHBB3 A:Hec1094.58
FeHG3 A:Pro54.98
FeCD A:Pro54.95
FeHD2 A:Pro54.51
FeHD3 A:Pro54.52
FeCE2 A:Phe204.68
FeHE2 A:Phe203.77
FeCD2 A:His222.93
FeHD1 A:His224.95
FeCG A:His224.07
FeHD2 A:His223.19
FeNE2 A:His221.93
FeHE1 A:His223.18
FeND1 A:His224.04
FeCE1 A:His222.93
FeHB2 A:Cys334.98
FeCD2 A:His342.94
FeHD1 A:His344.95
FeCG A:His344.08
FeHD2 A:His343.22
FeNE2 A:His341.94
FeHE1 A:His343.16
FeND1 A:His344.04
FeCE1 A:His342.92
FeC2D A:Hec1084.28
FeNA A:Hec1082.01
FeCHA A:Hec1083.44
FeC2A A:Hec1084.29
FeC1D A:Hec1083.06
FeC4A A:Hec1083.06
FeC4B A:Hec1083.06
FeC3A A:Hec1084.29
FeHHA A:Hec1084.53
FeC1C A:Hec1083.06
FeC2C A:Hec1084.29
FeNB A:Hec1082.02
FeHHC A:Hec1084.54
FeFE A:Hec1080.00
FeC3B A:Hec1084.29
FeC4D A:Hec1083.06
FeNC A:Hec1082.02
FeCHB A:Hec1083.45
FeCHC A:Hec1083.45
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FeHHB A:Hec1084.54
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FeCHD A:Hec1083.45
FeC1B A:Hec1083.06
FeHHD A:Hec1084.54
FeC3C A:Hec1084.29
FeC1A A:Hec1083.06
FeHBB3 A:Hec1094.58
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FeCD A:Pro54.95
FeHD2 A:Pro54.51
FeHD3 A:Pro54.52
FeCE2 A:Phe204.68
FeHE2 A:Phe203.77
FeCD2 A:His222.93
FeHD1 A:His224.95
FeCG A:His224.07
FeHD2 A:His223.19
FeNE2 A:His221.93
FeHE1 A:His223.18
FeND1 A:His224.04
FeCE1 A:His222.93
FeHB2 A:Cys334.98
FeCD2 A:His342.94
FeHD1 A:His344.95
FeCG A:His344.08
FeHD2 A:His343.22
FeNE2 A:His341.94
FeHE1 A:His343.16
FeND1 A:His344.04
FeCE1 A:His342.92
FeHB3 A:Tyr434.94
FeC2D A:Hec1084.28
FeNA A:Hec1082.01
FeCHA A:Hec1083.44
FeC2A A:Hec1084.29
FeC1D A:Hec1083.06
FeC4A A:Hec1083.06
FeC4B A:Hec1083.06
FeC3A A:Hec1084.29
FeHHA A:Hec1084.53
FeC1C A:Hec1083.06
FeC2C A:Hec1084.29
FeNB A:Hec1082.02
FeHHC A:Hec1084.54
FeFE A:Hec1080.00
FeC3B A:Hec1084.29
FeC4D A:Hec1083.06
FeNC A:Hec1082.02
FeCHB A:Hec1083.45
FeCHC A:Hec1083.45
FeC3D A:Hec1084.28
FeC4C A:Hec1083.06
FeC2B A:Hec1084.29
FeHHB A:Hec1084.54
FeND A:Hec1082.02
FeCHD A:Hec1083.45
FeC1B A:Hec1083.06
FeHHD A:Hec1084.54
FeC3C A:Hec1084.29
FeC1A A:Hec1083.06
FeHBB3 A:Hec1094.58
FeHG3 A:Pro54.98
FeCD A:Pro54.95
FeHD2 A:Pro54.51
FeHD3 A:Pro54.52
FeCE2 A:Phe204.68
FeHE2 A:Phe203.77
FeCD2 A:His222.93
FeHD1 A:His224.95
FeCG A:His224.07
FeHD2 A:His223.19
FeNE2 A:His221.93
FeHE1 A:His223.18
FeND1 A:His224.04
FeCE1 A:His222.93
FeHB2 A:Cys334.98
FeCD2 A:His342.94
FeHD1 A:His344.95
FeCG A:His344.08
FeHD2 A:His343.22
FeNE2 A:His341.94
FeHE1 A:His343.16
FeND1 A:His344.04
FeCE1 A:His342.92
FeHB3 A:Tyr434.94
FeC2D A:Hec1084.28
FeNA A:Hec1082.01
FeCHA A:Hec1083.44
FeC2A A:Hec1084.29
FeC1D A:Hec1083.06
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interactive model:


Iron binding site 2 out of 4 in 1a2i


Iron binding site 2 out of 4 in 1a2i
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stereopicture of Iron binding site 2 out of 4 in 1a2i
Click to enlarge
Mono- and Stereo- picture of 5.0 Angstrom coordination sphere 2 of Iron in the PDB 1a2i. Coordination sphere was calculated for all residues within 5.0 Angstroms distance from the central Iron atom, shown by VdW sphere
Residues shown as a stick model or VDW spheres: A: His35, A: Val37, A: Cys51, A: His52, A: Val68, A: Phe76, A: Hec109, A: His35, A: Val37, A: Cys46, A: Cys51, A: His52, A: Val68, A: Phe76, A: Hec109, A: His35, A: Val37, A: Cys51, A: His52, A: Val68, A: Phe76, A: Hec109, A: His35, A: Cys51, A: His52, A: Val68, A: Phe76, A: Hec109, A: His35, A: Val37, A: Cys51, A: His52, A: Val68, A: Phe76, A: Hec109, A: His35, A: Val37, A: Cys46, A: Cys51, A: His52, A: Val68, A: Phe76, A: Hec109, A: His35, A: Val37, A: Cys46, A: Cys51, A: His52, A: Val68, A: Hec109, A: His35, A: Val37, A: Cys51, A: His52, A: Val68, A: Phe76, A: Hec109, A: His35, A: Val37, A: Cys51, A: His52, A: Val68, A: Phe76, A: Hec109, A: His35, A: Val37, A: Cys46, A: Cys51, A: His52, A: Val68, A: Hec109, A: His35, A: Cys46, A: His52, A: Val68, A: Phe76, A: Hec109, A: His35, A: Val37, A: Cys51, A: His52, A: Val68, A: Hec109, A: His35, A: Val37, A: Cys46, A: Cys51, A: His52, A: Val68, A: Phe76, A: Hec109, A: His35, A: Cys46, A: His52, A: Val68, A: Phe76, A: Hec109, A: His35, A: Val37, A: Cys51, A: His52, A: Val68, A: Phe76, A: Hec109, A: His35, A: Val37, A: Cys46, A: Cys51, A: His52, A: Val68, A: Phe76, A: Hec109, A: His35, A: Val37, A: Cys51, A: His52, A: Val68, A: Phe76, A: Hec109, A: His35, A: Val37, A: Cys51, A: His52, A: Val68, A: Phe76, A: Hec109, A: His35, A: Cys46, A: Cys51, A: His52, A: Val68, A: Hec109, A: His35, A: His52, A: Val68, A: Phe76, A: Hec109,

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FeC4C A:Hec1093.07
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interactive model:


Iron binding site 3 out of 4 in 1a2i


Iron binding site 3 out of 4 in 1a2i
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stereopicture of Iron binding site 3 out of 4 in 1a2i
Click to enlarge
Mono- and Stereo- picture of 5.0 Angstrom coordination sphere 3 of Iron in the PDB 1a2i. Coordination sphere was calculated for all residues within 5.0 Angstroms distance from the central Iron atom, shown by VdW sphere
Residues shown as a stick model or VDW spheres: A: Phe20, A: Thr24, A: His25, A: His83, A: Leu97, A: Hec108, A: Hec110, A: Hec111, A: Phe20, A: His25, A: His83, A: Leu97, A: Hec108, A: Hec110, A: Hec111, A: Phe20, A: His25, A: Cys79, A: His83, A: Leu97, A: Hec108, A: Hec110, A: Hec111, A: Phe20, A: His25, A: His83, A: Leu97, A: Hec108, A: Hec110, A: Hec111, A: Phe20, A: His25, A: His83, A: Leu97, A: Hec108, A: Hec110, A: Hec111, A: Phe20, A: His25, A: Cys79, A: His83, A: Leu97, A: Hec108, A: Hec110, A: Hec111, A: Phe20, A: His25, A: Cys79, A: His83, A: Leu97, A: Hec108, A: Hec110, A: Hec111, A: Phe20, A: Thr24, A: His25, A: His83, A: Leu97, A: Hec108, A: Hec110, A: Hec111, A: Phe20, A: Thr24, A: His25, A: His83, A: Leu97, A: Hec108, A: Hec110, A: Hec111, A: Phe20, A: His25, A: Cys79, A: His83, A: Leu97, A: Hec108, A: Hec110, A: Hec111, A: Phe20, A: Thr24, A: His25, A: His83, A: Leu97, A: Hec108, A: Hec110, A: Hec111, A: Phe20, A: His25, A: Cys79, A: His83, A: Leu97, A: Hec108, A: Hec110, A: Hec111, A: Phe20, A: Thr24, A: His25, A: His83, A: Leu97, A: Hec108, A: Hec110, A: Hec111, A: Phe20, A: His25, A: Cys79, A: His83, A: Leu97, A: Hec108, A: Hec110, A: Hec111, A: Phe20, A: His25, A: Cys79, A: His83, A: Leu97, A: Hec108, A: Hec110, A: Hec111, A: Phe20, A: His25, A: Cys79, A: His83, A: Leu97, A: Hec108, A: Hec110, A: Hec111, A: Phe20, A: Thr24, A: His25, A: His83, A: Leu97, A: Hec108, A: Hec110, A: Hec111, A: Phe20, A: Thr24, A: His25, A: Cys79, A: His83, A: Leu97, A: Hec108, A: Hec110, A: Hec111, A: Phe20, A: Thr24, A: His25, A: Cys79, A: His83, A: Leu97, A: Hec108, A: Hec110, A: Hec111, A: Phe20, A: His25, A: Cys79, A: His83, A: Leu97, A: Hec108, A: Hec110, A: Hec111,

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interactive model:


Iron binding site 4 out of 4 in 1a2i


Iron binding site 4 out of 4 in 1a2i
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stereopicture of Iron binding site 4 out of 4 in 1a2i
Click to enlarge
Mono- and Stereo- picture of 5.0 Angstrom coordination sphere 4 of Iron in the PDB 1a2i. Coordination sphere was calculated for all residues within 5.0 Angstroms distance from the central Iron atom, shown by VdW sphere
Residues shown as a stick model or VDW spheres: A: Gln16, A: Val18, A: Tyr66, A: His70, A: His106, A: Hec111, A: Val18, A: Tyr66, A: His70, A: His106, A: Hec111, A: Gln16, A: Val18, A: Tyr66, A: His70, A: His106, A: Hec111, A: Gln16, A: Val18, A: Tyr66, A: His70, A: His106, A: Hec111, A: Gln16, A: Val18, A: Tyr66, A: His70, A: His106, A: Hec111, A: Gln16, A: Val18, A: Tyr66, A: His70, A: His106, A: Hec111, A: Gln16, A: Val18, A: Tyr66, A: Met69, A: His70, A: Cys105, A: His106, A: Hec111, A: Gln16, A: Val18, A: Tyr66, A: His70, A: His106, A: Hec111, A: Gln16, A: Val18, A: Tyr66, A: His70, A: His106, A: Hec111, A: Gln16, A: Val18, A: Tyr66, A: His70, A: Cys105, A: His106, A: Hec111, A: Val18, A: Tyr66, A: His70, A: His106, A: Hec111, A: Gln16, A: Val18, A: Tyr66, A: His70, A: Cys105, A: His106, A: Hec111, A: Gln16, A: Val18, A: Tyr66, A: His70, A: Cys105, A: His106, A: Hec111, A: Gln16, A: Val18, A: Tyr66, A: His70, A: His106, A: Hec111, A: Gln16, A: Val18, A: Tyr66, A: His70, A: His106, A: Hec111, A: Gln16, A: Val18, A: Tyr66, A: His70, A: His106, A: Hec111, A: Gln16, A: Val18, A: Tyr66, A: His70, A: Cys105, A: His106, A: Hec111, A: Gln16, A: Val18, A: Tyr66, A: Met69, A: His70, A: His106, A: Hec111, A: Gln16, A: Val18, A: Tyr66, A: His70, A: Cys105, A: His106, A: Hec111, A: Gln16, A: Val18, A: Tyr66, A: Met69, A: His70, A: Cys105, A: His106, A: Hec111,

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