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Iron in the structure of The Three Dimensional Structure of the Reduced High Potential Iron-Sulfur Protein From Chromatium Vinosum Through uc(Nmr) (pdb 1hrr)






The binding sites of Iron atom in the structure of The Three Dimensional Structure of the Reduced High Potential Iron-Sulfur Protein From Chromatium Vinosum Through uc(Nmr) (pdb code 1hrr). This binding sites where shown with 5.0 Angstroms radius around Iron atom.
The 1hrr structure was solved by L.BANCI, I.BERTINI, A.DIKIY, D.H.W.KASTRAU, C.LUCHINAT, P.SOMPORNPISUT, with NMR in Solution technique.


Iron Binding Sites:

Iron binding site 1 out of 4 in 1hrr


Iron binding site 1 out of 4 in 1hrr
Click to enlarge
stereopicture of Iron binding site 1 out of 4 in 1hrr
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Mono- and Stereo- picture of 5.0 Angstrom coordination sphere 1 of Iron in the PDB 1hrr. Coordination sphere was calculated for all residues within 5.0 Angstroms distance from the central Iron atom, shown by VdW sphere
Residues shown as a stick model or VDW spheres: A: Tyr19, A: Cys43, A: Cys46, A: Met49, A: Cys63, A: Ile71, A: Trp76, A: Cys77, A: Trp80, A: Sf486, A: Tyr19, A: Cys43, A: Cys46, A: Cys63, A: Ile71, A: Gly75, A: Trp76, A: Cys77, A: Trp80, A: Sf486, A: Tyr19, A: Cys43, A: Cys46, A: Cys63, A: Phe66, A: Ile71, A: Gly75, A: Trp76, A: Cys77, A: Trp80, A: Sf486, A: Tyr19, A: Cys43, A: Cys46, A: Cys63, A: Phe66, A: Ile71, A: Gly75, A: Trp76, A: Cys77, A: Trp80, A: Sf486, A: Tyr19, A: Cys43, A: Cys46, A: Cys63, A: Ile71, A: Gly75, A: Trp76, A: Cys77, A: Trp80, A: Sf486, A: Tyr19, A: Cys43, A: Cys46, A: Cys63, A: Ile71, A: Trp76, A: Cys77, A: Trp80, A: Sf486, A: Tyr19, A: Cys43, A: Cys46, A: Met49, A: Cys63, A: Phe66, A: Ile71, A: Trp76, A: Cys77, A: Trp80, A: Sf486, A: Tyr19, A: Cys43, A: Cys46, A: Cys63, A: Phe66, A: Ile71, A: Trp76, A: Cys77, A: Sf486, A: Tyr19, A: Cys43, A: Cys46, A: Cys63, A: Phe66, A: Ile71, A: Gly75, A: Trp76, A: Cys77, A: Trp80, A: Sf486, A: Tyr19, A: Cys43, A: Cys46, A: Cys63, A: Phe66, A: Ile71, A: Gly75, A: Trp76, A: Cys77, A: Trp80, A: Sf486, A: Tyr19, A: Cys43, A: Cys46, A: Met49, A: Cys63, A: Phe66, A: Ile71, A: Trp76, A: Cys77, A: Trp80, A: Sf486, A: Tyr19, A: Cys43, A: Cys46, A: Cys63, A: Phe66, A: Ile71, A: Gly75, A: Trp76, A: Cys77, A: Trp80, A: Sf486, A: Tyr19, A: Cys43, A: Cys46, A: Cys63, A: Ile71, A: Gly75, A: Trp76, A: Cys77, A: Trp80, A: Sf486, A: Tyr19, A: Cys43, A: Cys46, A: Cys63, A: Phe66, A: Ile71, A: Trp76, A: Cys77, A: Trp80, A: Sf486, A: Tyr19, A: Cys43, A: Cys46, A: Met49, A: Cys63, A: Ile71, A: Gly75, A: Trp76, A: Cys77, A: Trp80, A: Sf486,

conact list:


AtomAtomDistance (A)
FeHD1 A:Tyr194.19
FeHE1 A:Tyr194.83
FeHB2 A:Cys434.07
FeN A:Cys434.21
FeCB A:Cys433.12
FeHB3 A:Cys433.21
FeHA A:Cys433.01
FeSG A:Cys432.04
FeH A:Cys434.15
FeC A:Cys434.91
FeCA A:Cys433.59
FeHB2 A:Cys464.08
FeCB A:Cys464.39
FeHB3 A:Cys464.12
FeSG A:Cys464.27
FeHB2 A:Met494.95
FeHB2 A:Cys634.04
FeCB A:Cys634.73
FeSG A:Cys634.35
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FeHB A:Ile714.60
FeCB A:Ile714.82
FeHG12 A:Ile714.18
FeCD1 A:Ile714.94
FeCG2 A:Ile714.90
FeCG1 A:Ile714.04
FeHG23 A:Ile714.03
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FeS4 A:Sf4862.17
FeFE2 A:Sf4862.48
FeS2 A:Sf4862.16
FeFE4 A:Sf4862.50
FeS3 A:Sf4862.17
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FeFE4 A:Sf4862.50
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interactive model:


Iron binding site 2 out of 4 in 1hrr


Iron binding site 2 out of 4 in 1hrr
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stereopicture of Iron binding site 2 out of 4 in 1hrr
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Mono- and Stereo- picture of 5.0 Angstrom coordination sphere 2 of Iron in the PDB 1hrr. Coordination sphere was calculated for all residues within 5.0 Angstroms distance from the central Iron atom, shown by VdW sphere
Residues shown as a stick model or VDW spheres: A: Cys43, A: Cys46, A: Met49, A: Cys63, A: Gln64, A: Ile71, A: Cys77, A: Ser79, A: Trp80, A: Thr81, A: Sf486, A: Cys43, A: Cys46, A: Cys63, A: Gln64, A: Ile71, A: Cys77, A: Ser79, A: Trp80, A: Thr81, A: Sf486, A: Cys43, A: Cys46, A: Phe48, A: Cys63, A: Ile71, A: Cys77, A: Ser79, A: Trp80, A: Thr81, A: Sf486, A: Cys43, A: Cys46, A: Gln47, A: Met49, A: Cys63, A: Trp76, A: Cys77, A: Ser79, A: Trp80, A: Thr81, A: Sf486, A: Cys43, A: Cys46, A: Met49, A: Cys63, A: Cys77, A: Trp80, A: Sf486, A: Cys43, A: Cys46, A: Phe48, A: Cys63, A: Ile71, A: Cys77, A: Ser79, A: Trp80, A: Thr81, A: Sf486, A: Cys43, A: Cys46, A: Phe48, A: Met49, A: Cys63, A: Leu65, A: Ile71, A: Cys77, A: Ser79, A: Trp80, A: Thr81, A: Sf486, A: Cys43, A: Cys46, A: Gln47, A: Phe48, A: Cys63, A: Ile71, A: Cys77, A: Ser79, A: Trp80, A: Sf486, A: Cys43, A: Cys46, A: Gln47, A: Phe48, A: Met49, A: Cys63, A: Ile71, A: Cys77, A: Ser79, A: Trp80, A: Sf486, A: Cys43, A: Cys46, A: Phe48, A: Met49, A: Cys63, A: Cys77, A: Ser79, A: Trp80, A: Thr81, A: Sf486, A: Cys43, A: Cys46, A: Phe48, A: Met49, A: Cys63, A: Leu65, A: Ile71, A: Cys77, A: Ser79, A: Trp80, A: Sf486, A: Cys43, A: Cys46, A: Gln47, A: Met49, A: Cys63, A: Ile71, A: Cys77, A: Ser79, A: Trp80, A: Thr81, A: Sf486, A: Cys43, A: Cys46, A: Phe48, A: Cys63, A: Ile71, A: Trp76, A: Cys77, A: Ser79, A: Trp80, A: Sf486, A: Cys43, A: Cys46, A: Phe48, A: Met49, A: Cys63, A: Ile71, A: Cys77, A: Ser79, A: Trp80, A: Thr81, A: Sf486, A: Cys43, A: Cys46, A: Gln47, A: Met49, A: Cys63, A: Cys77, A: Ser79, A: Trp80, A: Sf486,

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interactive model:


Iron binding site 3 out of 4 in 1hrr


Iron binding site 3 out of 4 in 1hrr
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stereopicture of Iron binding site 3 out of 4 in 1hrr
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Mono- and Stereo- picture of 5.0 Angstrom coordination sphere 3 of Iron in the PDB 1hrr. Coordination sphere was calculated for all residues within 5.0 Angstroms distance from the central Iron atom, shown by VdW sphere
Residues shown as a stick model or VDW spheres: A: Leu17, A: Cys43, A: Cys46, A: Met49, A: Cys63, A: Gln64, A: Phe66, A: Ile71, A: Cys77, A: Ser79, A: Sf486, A: Leu17, A: Cys43, A: Cys46, A: Cys63, A: Gln64, A: Phe66, A: Ile71, A: Cys77, A: Sf486, A: Leu17, A: Cys43, A: Cys46, A: Phe48, A: Cys63, A: Leu65, A: Phe66, A: Ile71, A: Cys77, A: Ser79, A: Sf486, A: Leu17, A: Cys43, A: Cys46, A: Cys63, A: Leu65, A: Phe66, A: Ile71, A: Cys77, A: Ser79, A: Sf486, A: Cys43, A: Cys46, A: Met49, A: Cys63, A: Leu65, A: Phe66, A: Ile71, A: Cys77, A: Trp80, A: Sf486, A: Leu17, A: Tyr19, A: Cys43, A: Cys46, A: Phe48, A: Cys63, A: Leu65, A: Phe66, A: Ile71, A: Cys77, A: Sf486, A: Leu17, A: Cys43, A: Cys46, A: Phe48, A: Met49, A: Cys63, A: Leu65, A: Phe66, A: Ile71, A: Cys77, A: Ser79, A: Sf486, A: Leu17, A: Cys43, A: Phe48, A: Cys63, A: Leu65, A: Phe66, A: Ile71, A: Cys77, A: Ser79, A: Sf486, A: Leu17, A: Tyr19, A: Cys43, A: Cys46, A: Phe48, A: Cys63, A: Phe66, A: Ile71, A: Cys77, A: Sf486, A: Leu17, A: Cys43, A: Cys46, A: Phe48, A: Cys63, A: Leu65, A: Phe66, A: Ile71, A: Cys77, A: Ser79, A: Sf486, A: Leu17, A: Cys43, A: Cys46, A: Phe48, A: Cys63, A: Leu65, A: Phe66, A: Ile71, A: Cys77, A: Ser79, A: Sf486, A: Cys43, A: Cys46, A: Cys63, A: Leu65, A: Phe66, A: Ile71, A: Cys77, A: Ser79, A: Sf486, A: Leu17, A: Cys43, A: Cys46, A: Phe48, A: Cys63, A: Leu65, A: Phe66, A: Ile71, A: Cys77, A: Ser79, A: Sf486, A: Leu17, A: Cys43, A: Cys46, A: Phe48, A: Cys63, A: Gln64, A: Phe66, A: Ile71, A: Cys77, A: Ser79, A: Sf486, A: Leu17, A: Cys43, A: Cys46, A: Met49, A: Cys63, A: Gln64, A: Leu65, A: Phe66, A: Ile71, A: Cys77, A: Ser79, A: Trp80, A: Sf486,

conact list:


AtomAtomDistance (A)
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FeHA A:Cys633.72
FeSG A:Cys632.01
FeC A:Cys634.55
FeCA A:Cys633.96
FeHB2 A:Gln644.32
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FeCB A:Gln644.82
FeCD A:Gln644.75
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FeHG2 A:Gln644.78
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FeCD2 A:Phe664.94
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FeHG13 A:Ile713.62
FeCG2 A:Ile714.70
FeCG1 A:Ile714.66
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FeFE2 A:Sf4862.48
FeS2 A:Sf4862.15
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FeS3 A:Sf4863.64
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FeHA A:Cys434.84
FeSG A:Cys434.35
FeHB3 A:Cys464.78
FeSG A:Cys464.30
FeHB2 A:Cys632.94
FeCB A:Cys633.07
FeHB3 A:Cys633.88
FeHA A:Cys633.72
FeSG A:Cys632.01
FeC A:Cys634.55
FeCA A:Cys633.96
FeHB2 A:Gln644.32
FeN A:Gln644.75
FeHG3 A:Gln643.11
FeCB A:Gln644.82
FeCD A:Gln644.75
FeCG A:Gln644.17
FeHG2 A:Gln644.78
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FeCD2 A:Phe664.94
FeHD2 A:Phe663.87
FeHG13 A:Ile713.62
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FeCG1 A:Ile714.66
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FeHB3 A:Cys774.83
FeSG A:Cys774.17
FeS1 A:Sf4862.14
FeFE1 A:Sf4862.50
FeFE3 A:Sf4860.00
FeS4 A:Sf4862.15
FeFE2 A:Sf4862.48
FeS2 A:Sf4862.15
FeFE4 A:Sf4862.44
FeS3 A:Sf4863.64
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FeHA A:Cys434.84
FeSG A:Cys434.35
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FeSG A:Cys464.30
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FeHB2 A:Ser794.89
FeS1 A:Sf4862.14
FeFE1 A:Sf4862.50
FeFE3 A:Sf4860.00
FeS4 A:Sf4862.15
FeFE2 A:Sf4862.48
FeS2 A:Sf4862.15
FeFE4 A:Sf4862.44
FeS3 A:Sf4863.64
FeHD12 A:Leu174.87
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FeHA A:Cys434.84
FeSG A:Cys434.35
FeHB3 A:Cys464.78
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FeHA A:Cys633.72
FeSG A:Cys632.01
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FeS4 A:Sf4862.15
FeFE2 A:Sf4862.48
FeS2 A:Sf4862.15
FeFE4 A:Sf4862.44
FeS3 A:Sf4863.64
FeHB3 A:Cys434.72
FeHA A:Cys434.84
FeSG A:Cys434.35
FeHB3 A:Cys464.78
FeSG A:Cys464.30
FeHB2 A:Met494.92
FeHB2 A:Cys632.94
FeCB A:Cys633.07
FeHB3 A:Cys633.88
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FeS2 A:Sf4862.15
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interactive model:


Iron binding site 4 out of 4 in 1hrr


Iron binding site 4 out of 4 in 1hrr
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stereopicture of Iron binding site 4 out of 4 in 1hrr
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Mono- and Stereo- picture of 5.0 Angstrom coordination sphere 4 of Iron in the PDB 1hrr. Coordination sphere was calculated for all residues within 5.0 Angstroms distance from the central Iron atom, shown by VdW sphere
Residues shown as a stick model or VDW spheres: A: Leu17, A: Tyr19, A: Cys43, A: Cys46, A: Cys63, A: Gln64, A: Ile71, A: Trp76, A: Cys77, A: Ser79, A: Trp80, A: Sf486, A: Leu17, A: Tyr19, A: Cys43, A: Cys46, A: Cys63, A: Phe66, A: Ile71, A: Trp76, A: Cys77, A: Ser79, A: Trp80, A: Sf486, A: Leu17, A: Tyr19, A: Cys43, A: Cys46, A: Cys63, A: Phe66, A: Trp76, A: Cys77, A: Ala78, A: Ser79, A: Trp80, A: Sf486, A: Leu17, A: Tyr19, A: Cys43, A: Cys46, A: Cys63, A: Leu65, A: Phe66, A: Ile71, A: Trp76, A: Cys77, A: Ser79, A: Trp80, A: Sf486, A: Leu17, A: Tyr19, A: Cys43, A: Cys46, A: Cys63, A: Phe66, A: Ile71, A: Trp76, A: Cys77, A: Ser79, A: Trp80, A: Sf486, A: Leu17, A: Tyr19, A: Cys43, A: Cys46, A: Cys63, A: Phe66, A: Ile71, A: Trp76, A: Cys77, A: Ser79, A: Trp80, A: Sf486, A: Leu17, A: Tyr19, A: Cys43, A: Cys46, A: Phe48, A: Cys63, A: Leu65, A: Phe66, A: Ile71, A: Trp76, A: Cys77, A: Ser79, A: Trp80, A: Sf486, A: Leu17, A: Tyr19, A: Cys43, A: Cys63, A: Phe66, A: Ile71, A: Trp76, A: Cys77, A: Ala78, A: Ser79, A: Trp80, A: Sf486, A: Leu17, A: Tyr19, A: Cys43, A: Cys46, A: Cys63, A: Phe66, A: Ile71, A: Trp76, A: Cys77, A: Ser79, A: Trp80, A: Sf486, A: Leu17, A: Tyr19, A: Cys43, A: Cys46, A: Phe48, A: Cys63, A: Phe66, A: Ile71, A: Trp76, A: Cys77, A: Ala78, A: Ser79, A: Trp80, A: Sf486, A: Leu17, A: Tyr19, A: Cys43, A: Cys46, A: Cys63, A: Leu65, A: Phe66, A: Trp76, A: Cys77, A: Ala78, A: Ser79, A: Trp80, A: Sf486, A: Leu17, A: Tyr19, A: Cys43, A: Cys46, A: Cys63, A: Phe66, A: Ile71, A: Trp76, A: Cys77, A: Ser79, A: Trp80, A: Sf486, A: Leu17, A: Tyr19, A: Cys43, A: Cys46, A: Cys63, A: Phe66, A: Trp76, A: Cys77, A: Ala78, A: Ser79, A: Trp80, A: Sf486, A: Leu17, A: Tyr19, A: Cys43, A: Cys46, A: Cys63, A: Phe66, A: Ile71, A: Trp76, A: Cys77, A: Ser79, A: Trp80, A: Sf486, A: Leu17, A: Tyr19, A: Cys43, A: Cys46, A: Cys63, A: Ile71, A: Trp76, A: Cys77, A: Ser79, A: Trp80, A: Sf486,

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FeHA A:Cys774.83
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FeHA A:Cys774.83
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FeH A:Cys773.53
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FeS1 A:Sf4862.14
FeFE1 A:Sf4862.50
FeFE3 A:Sf4862.44
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