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Iron in the structure of uc(Nmr) Study of Reduced High Potential Iron Sulfur Protein (pdb 1noe)






The binding sites of Iron atom in the structure of uc(Nmr) Study of Reduced High Potential Iron Sulfur Protein (pdb code 1noe). This binding sites where shown with 5.0 Angstroms radius around Iron atom.
The 1noe structure was solved by D.BENTROP, I.BERTINI, F.CAPOZZI, A.DIKIY, L.ELTIS, C.LUCHINAT, with NMR in Solution technique.


Iron Binding Sites:

Iron binding site 1 out of 4 in 1noe


Iron binding site 1 out of 4 in 1noe
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stereopicture of Iron binding site 1 out of 4 in 1noe
Click to enlarge
Mono- and Stereo- picture of 5.0 Angstrom coordination sphere 1 of Iron in the PDB 1noe. Coordination sphere was calculated for all residues within 5.0 Angstroms distance from the central Iron atom, shown by VdW sphere
Residues shown as a stick model or VDW spheres: A: Tyr19, A: Cys43, A: Cys46, A: Met49, A: Cys63, A: Ile71, A: Trp76, A: Ser77, A: Trp80, A: Sf486, A: Tyr19, A: Cys43, A: Cys46, A: Cys63, A: Ile71, A: Trp76, A: Ser77, A: Trp80, A: Sf486, A: Cys43, A: Cys46, A: Cys63, A: Ile71, A: Trp76, A: Ser77, A: Trp80, A: Sf486, A: Cys43, A: Cys46, A: Cys63, A: Phe66, A: Ile71, A: Trp76, A: Ser77, A: Trp80, A: Sf486, A: Cys43, A: Cys46, A: Met49, A: Cys63, A: Ile71, A: Trp76, A: Ser77, A: Trp80, A: Sf486, A: Tyr19, A: Cys43, A: Cys46, A: Cys63, A: Ile71, A: Trp76, A: Ser77, A: Trp80, A: Sf486, A: Tyr19, A: Cys43, A: Cys46, A: Cys63, A: Ile71, A: Trp76, A: Ser77, A: Trp80, A: Sf486, A: Tyr19, A: Cys43, A: Cys46, A: Met49, A: Cys63, A: Ile71, A: Gly75, A: Trp76, A: Ser77, A: Trp80, A: Sf486, A: Tyr19, A: Cys43, A: Cys46, A: Cys63, A: Ile71, A: Gly75, A: Trp76, A: Ser77, A: Trp80, A: Sf486, A: Tyr19, A: Cys43, A: Cys46, A: Met49, A: Cys63, A: Ile71, A: Trp76, A: Ser77, A: Trp80, A: Sf486, A: Tyr19, A: Cys43, A: Cys46, A: Cys63, A: Ile71, A: Gly75, A: Trp76, A: Ser77, A: Trp80, A: Sf486, A: Cys43, A: Cys46, A: Cys63, A: Ile71, A: Trp76, A: Ser77, A: Trp80, A: Sf486, A: Cys43, A: Cys46, A: Met49, A: Cys63, A: Ile71, A: Trp76, A: Ser77, A: Trp80, A: Sf486, A: Cys43, A: Cys46, A: Cys63, A: Ile71, A: Gly75, A: Trp76, A: Ser77, A: Trp80, A: Sf486, A: Cys43, A: Cys46, A: Cys63, A: Phe66, A: Ile71, A: Trp76, A: Ser77, A: Trp80, A: Sf486,

conact list:


AtomAtomDistance (A)
FeCD1 A:Tyr194.93
FeHD1 A:Tyr194.17
FeHE1 A:Tyr194.66
FeHB2 A:Cys434.17
FeN A:Cys434.44
FeCB A:Cys433.22
FeHB3 A:Cys433.26
FeHA A:Cys433.07
FeSG A:Cys432.16
FeH A:Cys434.41
FeC A:Cys434.90
FeCA A:Cys433.68
FeHB2 A:Cys464.14
FeCB A:Cys464.56
FeHB3 A:Cys464.39
FeSG A:Cys464.46
FeHG3 A:Met494.95
FeHB2 A:Cys634.13
FeCB A:Cys634.91
FeSG A:Cys634.62
FeHG13 A:Ile712.99
FeHB A:Ile714.77
FeCB A:Ile714.97
FeHG12 A:Ile714.05
FeCD1 A:Ile714.66
FeCG1 A:Ile713.97
FeHG23 A:Ile714.45
FeHD13 A:Ile714.17
FeC A:Trp764.69
FeCA A:Trp764.71
FeHA A:Trp763.94
FeN A:Ser774.37
FeCB A:Ser774.69
FeHB3 A:Ser774.05
FeH A:Ser774.09
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FeHA A:Trp804.78
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FeFE3 A:Sf4862.66
FeS4 A:Sf4862.22
FeFE2 A:Sf4862.60
FeS2 A:Sf4862.22
FeFE4 A:Sf4862.61
FeS3 A:Sf4862.19
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FeHA A:Trp804.78
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FeFE2 A:Sf4862.60
FeS2 A:Sf4862.22
FeFE4 A:Sf4862.61
FeS3 A:Sf4862.19
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FeS2 A:Sf4862.22
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FeCB A:Cys464.56
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FeHD13 A:Ile714.17
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interactive model:


Iron binding site 2 out of 4 in 1noe


Iron binding site 2 out of 4 in 1noe
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stereopicture of Iron binding site 2 out of 4 in 1noe
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Mono- and Stereo- picture of 5.0 Angstrom coordination sphere 2 of Iron in the PDB 1noe. Coordination sphere was calculated for all residues within 5.0 Angstroms distance from the central Iron atom, shown by VdW sphere
Residues shown as a stick model or VDW spheres: A: Cys43, A: Cys46, A: Phe48, A: Met49, A: Cys63, A: Ser77, A: Ser79, A: Trp80, A: Sf486, A: Cys43, A: Cys46, A: Phe48, A: Met49, A: Cys63, A: Ile71, A: Ser77, A: Trp80, A: Thr81, A: Sf486, A: Cys43, A: Cys46, A: Met49, A: Cys63, A: Ile71, A: Ser77, A: Trp80, A: Thr81, A: Sf486, A: Cys43, A: Cys46, A: Phe48, A: Cys63, A: Ser77, A: Trp80, A: Thr81, A: Sf486, A: Cys43, A: Cys46, A: Phe48, A: Met49, A: Cys63, A: Ser77, A: Ser79, A: Trp80, A: Sf486, A: Cys43, A: Cys46, A: Phe48, A: Met49, A: Cys63, A: Ser77, A: Trp80, A: Thr81, A: Sf486, A: Cys43, A: Cys46, A: Phe48, A: Cys63, A: Ser77, A: Ser79, A: Trp80, A: Thr81, A: Sf486, A: Cys43, A: Cys46, A: Phe48, A: Met49, A: Cys63, A: Ile71, A: Trp76, A: Ser77, A: Ser79, A: Trp80, A: Sf486, A: Cys43, A: Cys46, A: Phe48, A: Met49, A: Cys63, A: Trp76, A: Ser77, A: Ser79, A: Trp80, A: Thr81, A: Sf486, A: Cys43, A: Cys46, A: Phe48, A: Met49, A: Cys63, A: Ser77, A: Trp80, A: Sf486, A: Cys43, A: Cys46, A: Phe48, A: Met49, A: Cys63, A: Ser77, A: Trp80, A: Thr81, A: Sf486, A: Cys43, A: Cys46, A: Phe48, A: Met49, A: Cys63, A: Ile71, A: Ser77, A: Ser79, A: Trp80, A: Thr81, A: Sf486, A: Cys43, A: Cys46, A: Phe48, A: Met49, A: Cys63, A: Ser77, A: Trp80, A: Sf486, A: Cys43, A: Cys46, A: Phe48, A: Met49, A: Cys63, A: Trp76, A: Ser77, A: Ser79, A: Trp80, A: Sf486, A: Cys43, A: Cys46, A: Phe48, A: Met49, A: Cys63, A: Ser77, A: Trp80, A: Sf486,

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interactive model:


Iron binding site 3 out of 4 in 1noe


Iron binding site 3 out of 4 in 1noe
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stereopicture of Iron binding site 3 out of 4 in 1noe
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Mono- and Stereo- picture of 5.0 Angstrom coordination sphere 3 of Iron in the PDB 1noe. Coordination sphere was calculated for all residues within 5.0 Angstroms distance from the central Iron atom, shown by VdW sphere
Residues shown as a stick model or VDW spheres: A: Leu17, A: Cys43, A: Cys46, A: Phe48, A: Met49, A: Cys63, A: Gln64, A: Leu65, A: Phe66, A: Ile71, A: Ser77, A: Sf486, A: Leu17, A: Cys43, A: Phe48, A: Met49, A: Cys63, A: Leu65, A: Phe66, A: Ile71, A: Ser77, A: Sf486, A: Leu17, A: Cys43, A: Cys46, A: Met49, A: Cys63, A: Gln64, A: Phe66, A: Ile71, A: Ser77, A: Sf486, A: Cys43, A: Phe48, A: Cys63, A: Gln64, A: Leu65, A: Phe66, A: Ile71, A: Ser77, A: Sf486, A: Leu17, A: Cys43, A: Cys46, A: Phe48, A: Met49, A: Cys63, A: Phe66, A: Ile71, A: Ser77, A: Sf486, A: Cys43, A: Cys46, A: Phe48, A: Cys63, A: Gln64, A: Leu65, A: Phe66, A: Ile71, A: Ser77, A: Sf486, A: Leu17, A: Cys43, A: Cys46, A: Cys63, A: Gln64, A: Phe66, A: Ile71, A: Ser77, A: Ser79, A: Sf486, A: Leu17, A: Cys43, A: Cys46, A: Phe48, A: Met49, A: Cys63, A: Gln64, A: Ile71, A: Ser77, A: Sf486, A: Cys43, A: Cys46, A: Met49, A: Cys63, A: Gln64, A: Phe66, A: Ile71, A: Trp76, A: Ser77, A: Sf486, A: Cys43, A: Cys46, A: Phe48, A: Met49, A: Cys63, A: Gln64, A: Phe66, A: Ile71, A: Ser77, A: Sf486, A: Cys43, A: Cys46, A: Phe48, A: Cys63, A: Gln64, A: Phe66, A: Ile71, A: Ser77, A: Sf486, A: Leu17, A: Cys43, A: Cys46, A: Phe48, A: Met49, A: Cys63, A: Phe66, A: Ile71, A: Ser77, A: Ser79, A: Sf486, A: Leu17, A: Cys43, A: Cys46, A: Phe48, A: Met49, A: Cys63, A: Gln64, A: Phe66, A: Ile71, A: Ser77, A: Sf486, A: Leu17, A: Cys43, A: Cys46, A: Phe48, A: Cys63, A: Gln64, A: Phe66, A: Ile71, A: Ser77, A: Sf486, A: Leu17, A: Cys43, A: Cys46, A: Cys63, A: Leu65, A: Phe66, A: Ile71, A: Ser77, A: Sf486,

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FeHE1 A:Phe663.78
FeCE1 A:Phe664.48
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FeS2 A:Sf4862.21
FeFE4 A:Sf4862.58
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FeC A:Cys634.95
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FeS2 A:Sf4862.21
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interactive model:


Iron binding site 4 out of 4 in 1noe


Iron binding site 4 out of 4 in 1noe
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stereopicture of Iron binding site 4 out of 4 in 1noe
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Mono- and Stereo- picture of 5.0 Angstrom coordination sphere 4 of Iron in the PDB 1noe. Coordination sphere was calculated for all residues within 5.0 Angstroms distance from the central Iron atom, shown by VdW sphere
Residues shown as a stick model or VDW spheres: A: Leu17, A: Tyr19, A: Cys43, A: Cys46, A: Cys63, A: Phe66, A: Trp76, A: Ser77, A: Ala78, A: Ser79, A: Trp80, A: Sf486, A: Leu17, A: Tyr19, A: Cys43, A: Cys46, A: Cys63, A: Phe66, A: Ile71, A: Trp76, A: Ser77, A: Ser79, A: Trp80, A: Sf486, A: Leu17, A: Cys43, A: Cys46, A: Cys63, A: Ile71, A: Trp76, A: Ser77, A: Ser79, A: Trp80, A: Sf486, A: Leu17, A: Cys43, A: Cys63, A: Phe66, A: Trp76, A: Ser77, A: Ala78, A: Ser79, A: Trp80, A: Sf486, A: Leu17, A: Cys43, A: Cys46, A: Cys63, A: Ile71, A: Trp76, A: Ser77, A: Ser79, A: Trp80, A: Sf486, A: Leu17, A: Cys43, A: Cys46, A: Cys63, A: Ile71, A: Trp76, A: Ser77, A: Ser79, A: Trp80, A: Sf486, A: Leu17, A: Tyr19, A: Cys43, A: Cys63, A: Phe66, A: Ile71, A: Trp76, A: Ser77, A: Ser79, A: Trp80, A: Sf486, A: Leu17, A: Tyr19, A: Cys43, A: Cys46, A: Cys63, A: Ile71, A: Trp76, A: Ser77, A: Ser79, A: Trp80, A: Sf486, A: Leu17, A: Tyr19, A: Cys43, A: Cys63, A: Phe66, A: Trp76, A: Ser77, A: Ala78, A: Ser79, A: Trp80, A: Sf486, A: Leu17, A: Tyr19, A: Cys43, A: Cys46, A: Cys63, A: Trp76, A: Ser77, A: Trp80, A: Sf486, A: Leu17, A: Tyr19, A: Cys43, A: Cys46, A: Cys63, A: Trp76, A: Ser77, A: Ser79, A: Trp80, A: Sf486, A: Leu17, A: Cys43, A: Cys46, A: Cys63, A: Ile71, A: Trp76, A: Ser77, A: Ser79, A: Trp80, A: Sf486, A: Leu17, A: Cys43, A: Cys46, A: Cys63, A: Phe66, A: Ile71, A: Trp76, A: Ser77, A: Ala78, A: Trp80, A: Sf486, A: Leu17, A: Cys43, A: Cys63, A: Phe66, A: Trp76, A: Ser77, A: Ala78, A: Ser79, A: Trp80, A: Sf486, A: Leu17, A: Cys43, A: Cys63, A: Phe66, A: Trp76, A: Ser77, A: Ala78, A: Trp80, A: Sf486,

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FeFE1 A:Sf4862.61
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FeS2 A:Sf4862.20
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