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    PDB 8cpp-9nse

Iron in the structure of Solution Structure of Desulfovibrio Vulgaris (Hildenborough) Ferricytochrome C3, uc(Nmr), 20 Structures (pdb 2bpn)






The binding sites of Iron atom in the structure of Solution Structure of Desulfovibrio Vulgaris (Hildenborough) Ferricytochrome C3, uc(Nmr), 20 Structures (pdb code 2bpn). This binding sites where shown with 5.0 Angstroms radius around Iron atom.
The 2bpn structure was solved by A.C.MESSIAS, A.P.AGUIAR, L.BRENNAN, A.V.XAVIER, D.L.TURNER, with NMR in Solution technique.


Iron Binding Sites:

Iron binding site 1 out of 4 in 2bpn


Iron binding site 1 out of 4 in 2bpn
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stereopicture of Iron binding site 1 out of 4 in 2bpn
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Mono- and Stereo- picture of 5.0 Angstrom coordination sphere 1 of Iron in the PDB 2bpn. Coordination sphere was calculated for all residues within 5.0 Angstroms distance from the central Iron atom, shown by VdW sphere
Residues shown as a stick model or VDW spheres: A: Pro5, A: Leu9, A: Phe20, A: His22, A: Cys33, A: His34, A: Tyr43, A: Hec108, A: Pro5, A: Leu9, A: Phe20, A: His22, A: His34, A: Tyr43, A: Hec108, A: Pro5, A: Leu9, A: Phe20, A: His22, A: His34, A: Tyr43, A: Hec108, A: Pro5, A: Leu9, A: Phe20, A: His22, A: His34, A: Tyr43, A: Hec108, A: Pro5, A: Leu9, A: Phe20, A: His22, A: His34, A: Tyr43, A: Hec108, A: Leu9, A: Phe20, A: His22, A: His34, A: Tyr43, A: Hec108, A: Pro5, A: Leu9, A: Phe20, A: His22, A: His34, A: Tyr43, A: Hec108, A: Pro5, A: Leu9, A: Phe20, A: His22, A: His34, A: Tyr43, A: Hec108, A: Pro5, A: Leu9, A: His22, A: His34, A: Tyr43, A: Hec108, A: Leu9, A: Phe20, A: His22, A: His34, A: Tyr43, A: Hec108, A: Leu9, A: Phe20, A: His22, A: His34, A: Tyr43, A: Hec108, A: Ala4, A: Leu9, A: Phe20, A: His22, A: His34, A: Tyr43, A: Hec108, A: Pro5, A: Leu9, A: Phe20, A: His22, A: His34, A: Tyr43, A: Hec108, A: Leu9, A: Phe20, A: His22, A: Cys33, A: His34, A: Tyr43, A: Hec108, A: Ala4, A: Leu9, A: Phe20, A: His22, A: His34, A: Tyr43, A: Hec108, A: Pro5, A: Leu9, A: Phe20, A: His22, A: His34, A: Tyr43, A: Hec108, A: Leu9, A: Phe20, A: His22, A: His34, A: Tyr43, A: Hec108, A: Leu9, A: Phe20, A: His22, A: His34, A: Tyr43, A: Hec108, A: Leu9, A: Phe20, A: His22, A: His34, A: Tyr43, A: Hec108, A: Pro5, A: Leu9, A: Phe20, A: His22, A: Cys33, A: His34, A: Tyr43, A: Hec108,

conact list:


AtomAtomDistance (A)
FeHD2 A:Pro54.95
FeHD23 A:Leu94.87
FeHE1 A:Phe203.95
FeCZ A:Phe204.62
FeHZ A:Phe203.87
FeCE1 A:Phe204.65
FeCD2 A:His223.05
FeCG A:His224.20
FeHD2 A:His223.30
FeNE2 A:His222.00
FeHE1 A:His223.27
FeND1 A:His224.16
FeCE1 A:His223.02
FeHB2 A:Cys334.96
FeHB3 A:Cys334.83
FeCD2 A:His342.93
FeHD1 A:His344.99
FeCG A:His344.09
FeHD2 A:His343.20
FeNE2 A:His341.89
FeHE1 A:His343.21
FeND1 A:His344.06
FeCE1 A:His342.93
FeCD2 A:Tyr434.81
FeHD2 A:Tyr434.33
FeCE2 A:Tyr434.80
FeHE2 A:Tyr434.30
FeC2D A:Hec1084.34
FeNA A:Hec1082.04
FeCHA A:Hec1083.50
FeC2A A:Hec1084.31
FeC1D A:Hec1083.11
FeC4A A:Hec1083.06
FeC4B A:Hec1083.01
FeC3A A:Hec1084.29
FeHHA A:Hec1084.58
FeC1C A:Hec1083.03
FeC2C A:Hec1084.27
FeNB A:Hec1081.96
FeHHC A:Hec1084.49
FeFE A:Hec1080.00
FeC3B A:Hec1084.24
FeC4D A:Hec1083.12
FeNC A:Hec1082.01
FeCHB A:Hec1083.43
FeCHC A:Hec1083.40
FeC3D A:Hec1084.35
FeC4C A:Hec1083.07
FeC2B A:Hec1084.24
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FeND A:Hec1082.08
FeCHD A:Hec1083.48
FeC1B A:Hec1083.02
FeHHD A:Hec1084.57
FeC3C A:Hec1084.29
FeC1A A:Hec1083.09
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FeNE2 A:His222.00
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FeHE1 A:His343.21
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FeCE1 A:His342.93
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FeCE2 A:Tyr434.80
FeHE2 A:Tyr434.30
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FeC3D A:Hec1084.35
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FeHE2 A:Tyr434.30
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FeNE2 A:His222.00
FeHE1 A:His223.27
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FeHD2 A:His343.20
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FeND1 A:His344.06
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FeHE1 A:His223.27
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FeND1 A:His344.06
FeCE1 A:His342.93
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FeHE2 A:Tyr434.30
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FeC2A A:Hec1084.31
FeC1D A:Hec1083.11
FeC4A A:Hec1083.06
FeC4B A:Hec1083.01
FeC3A A:Hec1084.29
FeHHA A:Hec1084.58
FeC1C A:Hec1083.03
FeC2C A:Hec1084.27
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FeFE A:Hec1080.00
FeC3B A:Hec1084.24
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FeNC A:Hec1082.01
FeCHB A:Hec1083.43
FeCHC A:Hec1083.40
FeC3D A:Hec1084.35
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FeND A:Hec1082.08
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FeHE1 A:His223.27
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FeCD2 A:His342.93
FeHD1 A:His344.99
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FeNE2 A:His341.89
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FeHHA A:Hec1084.58
FeC1C A:Hec1083.03
FeC2C A:Hec1084.27
FeNB A:Hec1081.96
FeHHC A:Hec1084.49
FeFE A:Hec1080.00
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interactive model:


Iron binding site 2 out of 4 in 2bpn


Iron binding site 2 out of 4 in 2bpn
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stereopicture of Iron binding site 2 out of 4 in 2bpn
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Mono- and Stereo- picture of 5.0 Angstrom coordination sphere 2 of Iron in the PDB 2bpn. Coordination sphere was calculated for all residues within 5.0 Angstroms distance from the central Iron atom, shown by VdW sphere
Residues shown as a stick model or VDW spheres: A: His35, A: Cys51, A: His52, A: Val68, A: Phe76, A: Hec109, A: His35, A: Val37, A: Cys46, A: Cys51, A: His52, A: Val68, A: Phe76, A: Hec109, A: His35, A: Val37, A: Cys46, A: Cys51, A: His52, A: Val68, A: Phe76, A: Hec109, A: His35, A: Val37, A: Cys51, A: His52, A: Val68, A: Phe76, A: Hec109, A: His35, A: Val37, A: Cys51, A: His52, A: Val68, A: Phe76, A: Hec109, A: His35, A: Val37, A: Cys46, A: Cys51, A: His52, A: Val68, A: Hec109, A: His35, A: Val37, A: Cys46, A: Cys51, A: His52, A: Val68, A: Phe76, A: Hec109, A: His35, A: Cys51, A: His52, A: Val68, A: Phe76, A: Hec109, A: His35, A: Val37, A: Cys46, A: Cys51, A: His52, A: Val68, A: Phe76, A: Hec109, A: His35, A: Val37, A: Cys46, A: Cys51, A: His52, A: Val68, A: Hec109, A: His35, A: Val37, A: Cys46, A: Cys51, A: His52, A: Val68, A: Phe76, A: Hec109, A: His35, A: Val37, A: Cys51, A: His52, A: Val68, A: Phe76, A: Hec109, A: His35, A: Val37, A: Cys51, A: His52, A: Val68, A: Phe76, A: Hec109, A: His35, A: Val37, A: Cys46, A: Cys51, A: His52, A: Val68, A: Hec109, A: His35, A: Val37, A: Cys46, A: Cys51, A: His52, A: Val68, A: Hec109, A: His35, A: Val37, A: Cys46, A: Cys51, A: His52, A: Val68, A: Hec109, A: His35, A: Val37, A: Cys51, A: His52, A: Val68, A: Phe76, A: Hec109, A: His35, A: Val37, A: Cys51, A: His52, A: Val68, A: Hec109, A: His35, A: Val37, A: Cys46, A: Cys51, A: His52, A: Val68, A: Phe76, A: Hec109, A: His35, A: Val37, A: Cys51, A: His52, A: Val68, A: Hec109,

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interactive model:


Iron binding site 3 out of 4 in 2bpn


Iron binding site 3 out of 4 in 2bpn
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stereopicture of Iron binding site 3 out of 4 in 2bpn
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Mono- and Stereo- picture of 5.0 Angstrom coordination sphere 3 of Iron in the PDB 2bpn. Coordination sphere was calculated for all residues within 5.0 Angstroms distance from the central Iron atom, shown by VdW sphere
Residues shown as a stick model or VDW spheres: A: His25, A: Cys79, A: His83, A: Hec110, A: Hec111, A: Phe20, A: His25, A: Cys82, A: His83, A: Hec108, A: Hec110, A: Hec111, A: Phe20, A: His25, A: His83, A: Hec108, A: Hec110, A: Hec111, A: Phe20, A: Thr24, A: His25, A: His83, A: Hec108, A: Hec110, A: Hec111, A: Phe20, A: Thr24, A: His25, A: Cys79, A: Cys82, A: His83, A: Hec108, A: Hec110, A: Hec111, A: Phe20, A: His25, A: His83, A: Hec108, A: Hec110, A: Hec111, A: Phe20, A: His25, A: Cys79, A: Cys82, A: His83, A: Hec110, A: Hec111, A: His25, A: His83, A: Hec108, A: Hec110, A: Hec111, A: His25, A: Cys82, A: His83, A: Hec110, A: Hec111, A: Phe20, A: His25, A: His83, A: Hec110, A: Hec111, A: Phe20, A: His25, A: Cys79, A: Cys82, A: His83, A: Hec110, A: Hec111, A: Phe20, A: His25, A: His83, A: Hec108, A: Hec110, A: Hec111, A: His25, A: Cys82, A: His83, A: Hec108, A: Hec110, A: Hec111, A: His25, A: His83, A: Hec110, A: Hec111, A: Phe20, A: Thr24, A: His25, A: His83, A: Hec110, A: Hec111, A: His25, A: His83, A: Hec108, A: Hec110, A: Hec111, A: His25, A: Cys79, A: His83, A: Hec108, A: Hec110, A: Hec111, A: Phe20, A: His25, A: Cys82, A: His83, A: Hec110, A: Hec111, A: Phe20, A: His25, A: His83, A: Hec108, A: Hec110, A: Hec111, A: His25, A: His83, A: Hec110, A: Hec111,

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Iron binding site 4 out of 4 in 2bpn


Iron binding site 4 out of 4 in 2bpn
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stereopicture of Iron binding site 4 out of 4 in 2bpn
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Mono- and Stereo- picture of 5.0 Angstrom coordination sphere 4 of Iron in the PDB 2bpn. Coordination sphere was calculated for all residues within 5.0 Angstroms distance from the central Iron atom, shown by VdW sphere
Residues shown as a stick model or VDW spheres: A: Val18, A: Tyr66, A: His70, A: Val80, A: Cys105, A: His106, A: Hec111, A: Val18, A: Tyr66, A: Met69, A: His70, A: Val80, A: Cys105, A: His106, A: Hec111, A: Val18, A: Tyr66, A: His70, A: Val80, A: His106, A: Hec111, A: Gln16, A: Val18, A: Tyr66, A: Met69, A: His70, A: Val80, A: Cys105, A: His106, A: Hec111, A: Gln16, A: Val18, A: Tyr66, A: His70, A: Val80, A: Cys105, A: His106, A: Hec111, A: Tyr66, A: Met69, A: His70, A: Val80, A: His106, A: Hec111, A: His70, A: Val80, A: Cys105, A: His106, A: Hec111, A: Val18, A: Tyr66, A: Met69, A: His70, A: Val80, A: Cys105, A: His106, A: Hec111, A: Val18, A: Tyr66, A: His70, A: Val80, A: His106, A: Hec111, A: Gln16, A: Tyr66, A: Met69, A: His70, A: Val80, A: Cys105, A: His106, A: Hec111, A: Tyr66, A: Met69, A: His70, A: Val80, A: Cys105, A: His106, A: Hec111, A: Val18, A: Tyr66, A: Met69, A: His70, A: Val80, A: Cys105, A: His106, A: Hec111, A: Val18, A: Tyr66, A: Met69, A: His70, A: Val80, A: His106, A: Hec111, A: Val18, A: Tyr66, A: Met69, A: His70, A: Val80, A: Cys105, A: His106, A: Hec111, A: Tyr66, A: Met69, A: His70, A: Val80, A: Cys105, A: His106, A: Hec111, A: Tyr66, A: Met69, A: His70, A: Val80, A: Cys105, A: His106, A: Hec111, A: His70, A: Val80, A: Cys105, A: His106, A: Hec111, A: Val18, A: Tyr66, A: Met69, A: His70, A: Val80, A: Cys105, A: His106, A: Hec111, A: Val18, A: Tyr66, A: Met69, A: His70, A: Val80, A: His106, A: Hec111, A: Val18, A: Tyr66, A: Met69, A: His70, A: Val80, A: Cys105, A: His106, A: Hec111,

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