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Iron in the structure of uc(Nmr) Solution Structures of Fully Oxidised Cytochrome C3 From Desulfovibrio Desulfuricans Atcc 27774 (pdb 2kmy)






The binding sites of Iron atom in the structure of uc(Nmr) Solution Structures of Fully Oxidised Cytochrome C3 From Desulfovibrio Desulfuricans Atcc 27774 (pdb code 2kmy). This binding sites where shown with 5.0 Angstroms radius around Iron atom.
The 2kmy structure was solved by D.L.TURNER, V.B.PAIXAO, H.VIS, with NMR in Solution technique.


Iron Binding Sites:

Iron binding site 1 out of 4 in 2kmy


Iron binding site 1 out of 4 in 2kmy
Click to enlarge
stereopicture of Iron binding site 1 out of 4 in 2kmy
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Mono- and Stereo- picture of 5.0 Angstrom coordination sphere 1 of Iron in the PDB 2kmy. Coordination sphere was calculated for all residues within 5.0 Angstroms distance from the central Iron atom, shown by VdW sphere
Residues shown as a stick model or VDW spheres: A: Pro5, A: Phe20, A: His22, A: Cys30, A: His34, A: Hem233, A: Val4, A: Pro5, A: Phe20, A: His22, A: His34, A: Tyr43, A: Hem233, A: Pro5, A: Phe20, A: His22, A: His34, A: Tyr43, A: Hem233, A: Pro5, A: Phe20, A: His22, A: Cys30, A: His34, A: Tyr43, A: Hem233, A: Pro5, A: Phe20, A: His22, A: His34, A: Tyr43, A: Hem233, A: Pro5, A: Phe20, A: His22, A: His34, A: Tyr43, A: Hem233, A: Pro5, A: Phe20, A: His22, A: His34, A: Tyr43, A: Hem233, A: Pro5, A: Phe20, A: His22, A: His34, A: Tyr43, A: Hem233, A: Val4, A: Pro5, A: Phe20, A: His22, A: His34, A: Tyr43, A: Hem233, A: Pro5, A: Phe20, A: His22, A: His34, A: Tyr43, A: Hem233, A: Pro5, A: Phe20, A: His22, A: His34, A: Tyr43, A: Hem233, A: Pro5, A: Phe20, A: His22, A: Cys30, A: His34, A: Tyr43, A: Hem233, A: Pro5, A: Phe20, A: His22, A: His34, A: Tyr43, A: Hem233, A: Pro5, A: Phe20, A: His22, A: His34, A: Tyr43, A: Hem233, A: Pro5, A: Phe20, A: His22, A: His34, A: Tyr43, A: Hem233, A: Pro5, A: Phe20, A: His22, A: His34, A: Tyr43, A: Hem233, A: Pro5, A: Phe20, A: His22, A: Cys30, A: Cys33, A: His34, A: Tyr43, A: Hem233, A: Pro5, A: Phe20, A: His22, A: His34, A: Tyr43, A: Hem233, A: Pro5, A: Phe20, A: His22, A: His34, A: Tyr43, A: Hem233, A: Val4, A: Pro5, A: Phe20, A: His22, A: His34, A: Tyr43, A: Hem233,

conact list:


AtomAtomDistance (A)
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Iron binding site 2 out of 4 in 2kmy


Iron binding site 2 out of 4 in 2kmy
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stereopicture of Iron binding site 2 out of 4 in 2kmy
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Mono- and Stereo- picture of 5.0 Angstrom coordination sphere 2 of Iron in the PDB 2kmy. Coordination sphere was calculated for all residues within 5.0 Angstroms distance from the central Iron atom, shown by VdW sphere
Residues shown as a stick model or VDW spheres: A: His35, A: Cys51, A: His52, A: Val67, A: His76, A: Hem251, A: His35, A: Cys51, A: His52, A: Val67, A: His76, A: Hem251, A: His35, A: Cys51, A: His52, A: Val67, A: His76, A: Hem251, A: His35, A: Cys51, A: His52, A: Val67, A: His76, A: Hem251, A: His35, A: Cys51, A: His52, A: Val67, A: His76, A: Hem251, A: His35, A: Cys51, A: His52, A: Val67, A: His76, A: Hem251, A: His35, A: Cys51, A: His52, A: Val67, A: Hem251, A: His35, A: Cys51, A: His52, A: Val67, A: His76, A: Hem251, A: His35, A: Cys51, A: His52, A: Val67, A: His76, A: Hem251, A: His35, A: Cys51, A: His52, A: Val67, A: His76, A: Hem251, A: His35, A: Cys51, A: His52, A: Val67, A: Hem251, A: His35, A: Cys51, A: His52, A: Val67, A: His76, A: Hem251, A: His35, A: His52, A: Val67, A: His76, A: Hem251, A: His35, A: His52, A: Val67, A: Hem251, A: His35, A: Cys51, A: His52, A: Val67, A: His76, A: Hem251, A: His35, A: Cys51, A: His52, A: Val67, A: His76, A: Hem251, A: His35, A: Cys51, A: His52, A: Val67, A: His76, A: Hem251, A: His35, A: Cys51, A: His52, A: Val67, A: His76, A: Hem251, A: His35, A: Cys51, A: His52, A: Val67, A: His76, A: Hem251, A: His35, A: Cys51, A: His52, A: Val67, A: Hem251,

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interactive model:


Iron binding site 3 out of 4 in 2kmy


Iron binding site 3 out of 4 in 2kmy
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stereopicture of Iron binding site 3 out of 4 in 2kmy
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Mono- and Stereo- picture of 5.0 Angstrom coordination sphere 3 of Iron in the PDB 2kmy. Coordination sphere was calculated for all residues within 5.0 Angstroms distance from the central Iron atom, shown by VdW sphere
Residues shown as a stick model or VDW spheres: A: Phe20, A: His25, A: Cys79, A: His83, A: Leu97, A: Hem233, A: Hem282, A: Phe20, A: His25, A: Cys79, A: His83, A: Leu97, A: Hem233, A: Hem282, A: Phe20, A: His25, A: Cys79, A: His83, A: Leu97, A: Hem282, A: Phe20, A: His25, A: Cys79, A: His83, A: Leu97, A: Hem233, A: Hem282, A: Phe20, A: His25, A: Cys79, A: His83, A: Leu97, A: Hem282, A: Phe20, A: His25, A: Cys79, A: His83, A: Leu97, A: Hem282, A: Phe20, A: His25, A: Cys79, A: His83, A: Leu97, A: Hem282, A: Phe20, A: His25, A: Cys79, A: His83, A: Leu97, A: Hem282, A: Phe20, A: His25, A: Cys79, A: His83, A: Leu97, A: Hem233, A: Hem282, A: Phe20, A: His25, A: Cys79, A: His83, A: Leu97, A: Hem282, A: Phe20, A: His25, A: Cys79, A: His83, A: Leu97, A: Hem282, A: Phe20, A: His25, A: Cys79, A: His83, A: Leu97, A: Hem233, A: Hem282, A: Phe20, A: His25, A: Cys79, A: Cys82, A: His83, A: Leu97, A: Hem233, A: Hem282, A: Phe20, A: His25, A: Cys79, A: His83, A: Leu97, A: Hem282, A: Phe20, A: His25, A: Cys82, A: His83, A: Leu97, A: Hem282, A: Phe20, A: His25, A: Cys79, A: His83, A: Leu97, A: Hem282, A: Phe20, A: His25, A: Cys79, A: His83, A: Leu97, A: Hem233, A: Hem282, A: Phe20, A: His25, A: Cys79, A: His83, A: Leu97, A: Hem233, A: Hem282, A: Phe20, A: His25, A: Cys79, A: His83, A: Leu97, A: Hem282, A: Phe20, A: His25, A: Cys79, A: His83, A: Leu97, A: Hem282,

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interactive model:


Iron binding site 4 out of 4 in 2kmy


Iron binding site 4 out of 4 in 2kmy
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stereopicture of Iron binding site 4 out of 4 in 2kmy
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Mono- and Stereo- picture of 5.0 Angstrom coordination sphere 4 of Iron in the PDB 2kmy. Coordination sphere was calculated for all residues within 5.0 Angstroms distance from the central Iron atom, shown by VdW sphere
Residues shown as a stick model or VDW spheres: A: Tyr65, A: Val68, A: His69, A: Leu80, A: Cys105, A: His106, A: Hem305, A: Tyr65, A: Val68, A: His69, A: His106, A: Hem305, A: Tyr65, A: Val68, A: His69, A: His106, A: Hem305, A: Tyr65, A: Val68, A: His69, A: Cys105, A: His106, A: Hem305, A: Tyr65, A: Val68, A: His69, A: Cys105, A: His106, A: Hem305, A: Tyr65, A: Val68, A: His69, A: His106, A: Hem305, A: Tyr65, A: His69, A: His106, A: Hem305, A: Tyr65, A: Val68, A: His69, A: His106, A: Hem305, A: Tyr65, A: Val68, A: His69, A: Cys105, A: His106, A: Hem305, A: Tyr65, A: Val68, A: His69, A: His106, A: Hem305, A: Tyr65, A: Val68, A: His69, A: Cys105, A: His106, A: Hem305, A: Tyr65, A: Val68, A: His69, A: Leu80, A: His106, A: Hem305, A: Tyr65, A: Val68, A: His69, A: His106, A: Hem305, A: Tyr65, A: Val68, A: His69, A: His106, A: Hem305, A: Tyr65, A: Val68, A: His69, A: His106, A: Hem305, A: Tyr65, A: Val68, A: His69, A: His106, A: Hem305, A: Tyr65, A: Val68, A: His69, A: His106, A: Hem305, A: Tyr65, A: Val68, A: His69, A: Leu80, A: His106, A: Hem305, A: Tyr65, A: Val68, A: His69, A: His106, A: Hem305, A: Tyr65, A: Val68, A: His69, A: His106, A: Hem305,

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