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Iron in the structure of Solution Structure of Desulfovibrio Gigas Ferricytochrome C3, uc(Nmr), 15 Structures (pdb 1qn1)






The binding sites of Iron atom in the structure of Solution Structure of Desulfovibrio Gigas Ferricytochrome C3, uc(Nmr), 15 Structures (pdb code 1qn1). This binding sites where shown with 5.0 Angstroms radius around Iron atom.
The 1qn1 structure was solved by L.BRENNAN, A.C.MESSIAS, J.LEGALL, D.L.TURNER, A.V.XAVIER, with NMR in Solution technique.


Iron Binding Sites:

Iron binding site 1 out of 4 in 1qn1


Iron binding site 1 out of 4 in 1qn1
Click to enlarge
stereopicture of Iron binding site 1 out of 4 in 1qn1
Click to enlarge
Mono- and Stereo- picture of 5.0 Angstrom coordination sphere 1 of Iron in the PDB 1qn1. Coordination sphere was calculated for all residues within 5.0 Angstroms distance from the central Iron atom, shown by VdW sphere
Residues shown as a stick model or VDW spheres: A: Val3, A: Pro4, A: Phe24, A: His26, A: Cys37, A: His38, A: Hec113, A: Val3, A: Pro4, A: Phe24, A: His26, A: Cys37, A: His38, A: Hec113, A: Val3, A: Pro4, A: Phe24, A: His26, A: Cys37, A: His38, A: Hec113, A: Val3, A: Pro4, A: His26, A: Cys34, A: His38, A: Tyr46, A: Hec113, A: Val3, A: Pro4, A: Phe24, A: His26, A: Cys37, A: His38, A: Hec113, A: Val3, A: Pro4, A: Phe24, A: His26, A: Cys37, A: His38, A: Hec113, A: Pro4, A: Phe24, A: His26, A: Cys37, A: His38, A: Hec113, A: Val3, A: Pro4, A: His26, A: Cys34, A: His38, A: Tyr46, A: Hec113, A: Val3, A: Phe24, A: His26, A: Cys37, A: His38, A: Hec113, A: Val3, A: Phe24, A: His26, A: Cys37, A: His38, A: Hec113, A: Pro4, A: Phe24, A: His26, A: Cys37, A: His38, A: Tyr46, A: Hec113, A: Val3, A: Phe24, A: His26, A: Cys37, A: His38, A: Tyr46, A: Hec113, A: Val3, A: Pro4, A: Phe24, A: His26, A: His38, A: Tyr46, A: Hec113, A: Val3, A: Pro4, A: Phe24, A: His26, A: Cys34, A: His38, A: Hec113, A: Val3, A: Phe24, A: His26, A: Cys37, A: His38, A: Tyr46, A: Hec113,

conact list:


AtomAtomDistance (A)
FeHG21 A:Val34.59
FeHG23 A:Val34.67
FeHG3 A:Pro44.22
FeCG A:Pro44.91
FeHD2 A:Pro44.71
FeHG2 A:Pro44.75
FeCE2 A:Phe244.54
FeHZ A:Phe244.74
FeHE2 A:Phe243.50
FeCD2 A:His262.94
FeCG A:His264.11
FeHD2 A:His263.20
FeNE2 A:His261.91
FeHE1 A:His263.23
FeND1 A:His264.08
FeCE1 A:His262.95
FeHB2 A:Cys374.93
FeCD2 A:His383.04
FeCG A:His384.20
FeHD2 A:His383.30
FeNE2 A:His382.00
FeHE1 A:His383.27
FeND1 A:His384.16
FeCE1 A:His383.02
FeC2D A:Hec1134.31
FeNA A:Hec1131.98
FeCHA A:Hec1133.43
FeC2A A:Hec1134.25
FeC1D A:Hec1133.09
FeC4A A:Hec1133.02
FeC4B A:Hec1133.06
FeC3A A:Hec1134.25
FeHHA A:Hec1134.51
FeC1C A:Hec1133.09
FeC2C A:Hec1134.33
FeNB A:Hec1132.01
FeHHC A:Hec1134.54
FeFE A:Hec1130.00
FeC3B A:Hec1134.28
FeC4D A:Hec1133.06
FeNC A:Hec1132.06
FeCHB A:Hec1133.42
FeCHC A:Hec1133.47
FeC3D A:Hec1134.30
FeC4C A:Hec1133.11
FeC2B A:Hec1134.27
FeHHB A:Hec1134.51
FeND A:Hec1132.03
FeCHD A:Hec1133.49
FeC1B A:Hec1133.04
FeHHD A:Hec1134.58
FeC3C A:Hec1134.33
FeC1A A:Hec1133.03
FeHG21 A:Val34.59
FeHG23 A:Val34.67
FeHG3 A:Pro44.22
FeCG A:Pro44.91
FeHD2 A:Pro44.71
FeHG2 A:Pro44.75
FeCE2 A:Phe244.54
FeHZ A:Phe244.74
FeHE2 A:Phe243.50
FeCD2 A:His262.94
FeCG A:His264.11
FeHD2 A:His263.20
FeNE2 A:His261.91
FeHE1 A:His263.23
FeND1 A:His264.08
FeCE1 A:His262.95
FeHB2 A:Cys374.93
FeCD2 A:His383.04
FeCG A:His384.20
FeHD2 A:His383.30
FeNE2 A:His382.00
FeHE1 A:His383.27
FeND1 A:His384.16
FeCE1 A:His383.02
FeC2D A:Hec1134.31
FeNA A:Hec1131.98
FeCHA A:Hec1133.43
FeC2A A:Hec1134.25
FeC1D A:Hec1133.09
FeC4A A:Hec1133.02
FeC4B A:Hec1133.06
FeC3A A:Hec1134.25
FeHHA A:Hec1134.51
FeC1C A:Hec1133.09
FeC2C A:Hec1134.33
FeNB A:Hec1132.01
FeHHC A:Hec1134.54
FeFE A:Hec1130.00
FeC3B A:Hec1134.28
FeC4D A:Hec1133.06
FeNC A:Hec1132.06
FeCHB A:Hec1133.42
FeCHC A:Hec1133.47
FeC3D A:Hec1134.30
FeC4C A:Hec1133.11
FeC2B A:Hec1134.27
FeHHB A:Hec1134.51
FeND A:Hec1132.03
FeCHD A:Hec1133.49
FeC1B A:Hec1133.04
FeHHD A:Hec1134.58
FeC3C A:Hec1134.33
FeC1A A:Hec1133.03
FeHG21 A:Val34.59
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FeHG3 A:Pro44.22
FeCG A:Pro44.91
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FeHG2 A:Pro44.75
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FeHZ A:Phe244.74
FeHE2 A:Phe243.50
FeCD2 A:His262.94
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FeNE2 A:His261.91
FeHE1 A:His263.23
FeND1 A:His264.08
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FeCG A:His384.20
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FeNE2 A:His382.00
FeHE1 A:His383.27
FeND1 A:His384.16
FeCE1 A:His383.02
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FeNA A:Hec1131.98
FeCHA A:Hec1133.43
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FeC3A A:Hec1134.25
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FeC1C A:Hec1133.09
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FeNB A:Hec1132.01
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FeNC A:Hec1132.06
FeCHB A:Hec1133.42
FeCHC A:Hec1133.47
FeC3D A:Hec1134.30
FeC4C A:Hec1133.11
FeC2B A:Hec1134.27
FeHHB A:Hec1134.51
FeND A:Hec1132.03
FeCHD A:Hec1133.49
FeC1B A:Hec1133.04
FeHHD A:Hec1134.58
FeC3C A:Hec1134.33
FeC1A A:Hec1133.03
FeHG21 A:Val34.59
FeHG23 A:Val34.67
FeHG3 A:Pro44.22
FeCG A:Pro44.91
FeHD2 A:Pro44.71
FeHG2 A:Pro44.75
FeCD2 A:His262.94
FeCG A:His264.11
FeHD2 A:His263.20
FeNE2 A:His261.91
FeHE1 A:His263.23
FeND1 A:His264.08
FeCE1 A:His262.95
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FeCG A:His384.20
FeHD2 A:His383.30
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FeHE1 A:His383.27
FeND1 A:His384.16
FeCE1 A:His383.02
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FeNA A:Hec1131.98
FeCHA A:Hec1133.43
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FeC3A A:Hec1134.25
FeHHA A:Hec1134.51
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FeFE A:Hec1130.00
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FeNC A:Hec1132.06
FeCHB A:Hec1133.42
FeCHC A:Hec1133.47
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FeND A:Hec1132.03
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FeC1A A:Hec1133.03
FeHG21 A:Val34.59
FeHG23 A:Val34.67
FeHG3 A:Pro44.22
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FeHG2 A:Pro44.75
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FeHE2 A:Phe243.50
FeCD2 A:His262.94
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FeNE2 A:His261.91
FeHE1 A:His263.23
FeND1 A:His264.08
FeCE1 A:His262.95
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FeCD2 A:His383.04
FeCG A:His384.20
FeHD2 A:His383.30
FeNE2 A:His382.00
FeHE1 A:His383.27
FeND1 A:His384.16
FeCE1 A:His383.02
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FeCHA A:Hec1133.43
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FeHHA A:Hec1134.51
FeC1C A:Hec1133.09
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FeFE A:Hec1130.00
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FeC1A A:Hec1133.03
FeHG21 A:Val34.59
FeHG23 A:Val34.67
FeHG3 A:Pro44.22
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FeHD2 A:Pro44.71
FeHG2 A:Pro44.75
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FeHZ A:Phe244.74
FeHE2 A:Phe243.50
FeCD2 A:His262.94
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FeHD2 A:His263.20
FeNE2 A:His261.91
FeHE1 A:His263.23
FeND1 A:His264.08
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FeHD2 A:His383.30
FeNE2 A:His382.00
FeHE1 A:His383.27
FeND1 A:His384.16
FeCE1 A:His383.02
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FeCHA A:Hec1133.43
FeC2A A:Hec1134.25
FeC1D A:Hec1133.09
FeC4A A:Hec1133.02
FeC4B A:Hec1133.06
FeC3A A:Hec1134.25
FeHHA A:Hec1134.51
FeC1C A:Hec1133.09
FeC2C A:Hec1134.33
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FeHHC A:Hec1134.54
FeFE A:Hec1130.00
FeC3B A:Hec1134.28
FeC4D A:Hec1133.06
FeNC A:Hec1132.06
FeCHB A:Hec1133.42
FeCHC A:Hec1133.47
FeC3D A:Hec1134.30
FeC4C A:Hec1133.11
FeC2B A:Hec1134.27
FeHHB A:Hec1134.51
FeND A:Hec1132.03
FeCHD A:Hec1133.49
FeC1B A:Hec1133.04
FeHHD A:Hec1134.58
FeC3C A:Hec1134.33
FeC1A A:Hec1133.03
FeHG3 A:Pro44.22
FeCG A:Pro44.91
FeHD2 A:Pro44.71
FeHG2 A:Pro44.75
FeCE2 A:Phe244.54
FeHZ A:Phe244.74
FeHE2 A:Phe243.50
FeCD2 A:His262.94
FeCG A:His264.11
FeHD2 A:His263.20
FeNE2 A:His261.91
FeHE1 A:His263.23
FeND1 A:His264.08
FeCE1 A:His262.95
FeHB2 A:Cys374.93
FeCD2 A:His383.04
FeCG A:His384.20
FeHD2 A:His383.30
FeNE2 A:His382.00
FeHE1 A:His383.27
FeND1 A:His384.16
FeCE1 A:His383.02
FeC2D A:Hec1134.31
FeNA A:Hec1131.98
FeCHA A:Hec1133.43
FeC2A A:Hec1134.25
FeC1D A:Hec1133.09
FeC4A A:Hec1133.02
FeC4B A:Hec1133.06
FeC3A A:Hec1134.25
FeHHA A:Hec1134.51
FeC1C A:Hec1133.09
FeC2C A:Hec1134.33
FeNB A:Hec1132.01
FeHHC A:Hec1134.54
FeFE A:Hec1130.00
FeC3B A:Hec1134.28
FeC4D A:Hec1133.06
FeNC A:Hec1132.06
FeCHB A:Hec1133.42
FeCHC A:Hec1133.47
FeC3D A:Hec1134.30
FeC4C A:Hec1133.11
FeC2B A:Hec1134.27
FeHHB A:Hec1134.51
FeND A:Hec1132.03
FeCHD A:Hec1133.49
FeC1B A:Hec1133.04
FeHHD A:Hec1134.58
FeC3C A:Hec1134.33
FeC1A A:Hec1133.03
FeHG21 A:Val34.59
FeHG23 A:Val34.67
FeHG3 A:Pro44.22
FeCG A:Pro44.91
FeHD2 A:Pro44.71
FeHG2 A:Pro44.75
FeCD2 A:His262.94
FeCG A:His264.11
FeHD2 A:His263.20
FeNE2 A:His261.91
FeHE1 A:His263.23
FeND1 A:His264.08
FeCE1 A:His262.95
FeCD2 A:His383.04
FeCG A:His384.20
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interactive model:


Iron binding site 2 out of 4 in 1qn1


Iron binding site 2 out of 4 in 1qn1
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stereopicture of Iron binding site 2 out of 4 in 1qn1
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Mono- and Stereo- picture of 5.0 Angstrom coordination sphere 2 of Iron in the PDB 1qn1. Coordination sphere was calculated for all residues within 5.0 Angstroms distance from the central Iron atom, shown by VdW sphere
Residues shown as a stick model or VDW spheres: A: His39, A: Gln40, A: Cys54, A: His55, A: Val71, A: Hec114, A: His39, A: Gln40, A: His55, A: Val65, A: Hec114, A: His39, A: Gln40, A: His55, A: Val65, A: Val71, A: Hec114, A: His39, A: Cys54, A: His55, A: Val65, A: Val71, A: Hec114, A: His39, A: Gln40, A: His55, A: Val71, A: Hec114, A: His39, A: Gln40, A: Cys49, A: His55, A: Val65, A: Val71, A: Hec114, A: His39, A: Gln40, A: His55, A: Val71, A: Hec114, A: His39, A: His55, A: Val71, A: Hec114, A: His39, A: His55, A: Val71, A: Hec114, A: His39, A: Gln40, A: His55, A: Val71, A: Hec114, A: His39, A: Cys49, A: His55, A: Val71, A: Hec114, A: His39, A: Gln40, A: His55, A: Val65, A: Val71, A: Hec114, A: His39, A: His55, A: Val71, A: Hec114, A: His39, A: Gln40, A: Cys54, A: His55, A: Val71, A: Hec114, A: His39, A: Gln40, A: His55, A: Val71, A: Hec114,

conact list:


AtomAtomDistance (A)
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FeND1 A:His394.06
FeCE1 A:His392.92
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FeHE22 A:Gln404.00
FeHB3 A:Cys544.88
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FeHD2 A:His553.30
FeNE2 A:His552.00
FeHE1 A:His553.27
FeND1 A:His554.16
FeCE1 A:His553.02
FeHG13 A:Val715.00
FeHG23 A:Val714.74
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FeCHA A:Hec1143.46
FeC2A A:Hec1144.30
FeC1D A:Hec1143.07
FeC4A A:Hec1143.07
FeC4B A:Hec1143.05
FeC3A A:Hec1144.29
FeHHA A:Hec1144.55
FeC1C A:Hec1143.06
FeC2C A:Hec1144.29
FeNB A:Hec1142.02
FeHHC A:Hec1144.53
FeFE A:Hec1140.00
FeC3B A:Hec1144.28
FeC4D A:Hec1143.08
FeNC A:Hec1142.02
FeCHB A:Hec1143.45
FeCHC A:Hec1143.44
FeC3D A:Hec1144.30
FeC4C A:Hec1143.07
FeC2B A:Hec1144.29
FeHHB A:Hec1144.54
FeND A:Hec1142.03
FeCHD A:Hec1143.45
FeC1B A:Hec1143.06
FeHHD A:Hec1144.54
FeC3C A:Hec1144.29
FeC1A A:Hec1143.07
FeCD2 A:His392.95
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FeCE1 A:His553.02
FeC2D A:Hec1144.30
FeNA A:Hec1142.03
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FeC2A A:Hec1144.30
FeC1D A:Hec1143.07
FeC4A A:Hec1143.07
FeC4B A:Hec1143.05
FeC3A A:Hec1144.29
FeHHA A:Hec1144.55
FeC1C A:Hec1143.06
FeC2C A:Hec1144.29
FeNB A:Hec1142.02
FeHHC A:Hec1144.53
FeFE A:Hec1140.00
FeC3B A:Hec1144.28
FeC4D A:Hec1143.08
FeNC A:Hec1142.02
FeCHB A:Hec1143.45
FeCHC A:Hec1143.44
FeC3D A:Hec1144.30
FeC4C A:Hec1143.07
FeC2B A:Hec1144.29
FeHHB A:Hec1144.54
FeND A:Hec1142.03
FeCHD A:Hec1143.45
FeC1B A:Hec1143.06
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FeHG13 A:Val715.00
FeHG23 A:Val714.74
FeC2D A:Hec1144.30
FeNA A:Hec1142.03
FeCHA A:Hec1143.46
FeC2A A:Hec1144.30
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FeC4A A:Hec1143.07
FeC4B A:Hec1143.05
FeC3A A:Hec1144.29
FeHHA A:Hec1144.55
FeC1C A:Hec1143.06
FeC2C A:Hec1144.29
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Iron binding site 3 out of 4 in 1qn1


Iron binding site 3 out of 4 in 1qn1
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stereopicture of Iron binding site 3 out of 4 in 1qn1
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Mono- and Stereo- picture of 5.0 Angstrom coordination sphere 3 of Iron in the PDB 1qn1. Coordination sphere was calculated for all residues within 5.0 Angstroms distance from the central Iron atom, shown by VdW sphere
Residues shown as a stick model or VDW spheres: A: Thr28, A: His29, A: His87, A: Leu101, A: Hec115, A: Hec116, A: Thr28, A: His29, A: His87, A: Leu101, A: Hec115, A: Thr28, A: His29, A: His87, A: Leu101, A: Hec115, A: Thr28, A: His29, A: His87, A: Leu101, A: Hec113, A: Hec115, A: Thr28, A: His29, A: His87, A: Leu101, A: Hec115, A: Thr28, A: His29, A: His87, A: Hec115, A: Hec116, A: Thr28, A: His29, A: His87, A: Leu101, A: Hec115, A: Thr28, A: His29, A: His87, A: Hec113, A: Hec115, A: Thr28, A: His29, A: His87, A: Leu101, A: Hec115, A: Thr28, A: His29, A: His87, A: Leu101, A: Hec115, A: Hec116, A: Thr28, A: His29, A: His87, A: Leu101, A: Hec115, A: Thr28, A: His29, A: His87, A: Hec115, A: Hec116, A: Phe24, A: Thr28, A: His29, A: His87, A: Leu101, A: Hec113, A: Hec115, A: Thr28, A: His29, A: His87, A: Leu101, A: Hec113, A: Hec115, A: Thr28, A: His29, A: His87, A: Leu101, A: Hec115, A: Hec116,

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interactive model:


Iron binding site 4 out of 4 in 1qn1


Iron binding site 4 out of 4 in 1qn1
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stereopicture of Iron binding site 4 out of 4 in 1qn1
Click to enlarge
Mono- and Stereo- picture of 5.0 Angstrom coordination sphere 4 of Iron in the PDB 1qn1. Coordination sphere was calculated for all residues within 5.0 Angstroms distance from the central Iron atom, shown by VdW sphere
Residues shown as a stick model or VDW spheres: A: Tyr69, A: Val72, A: His73, A: Cys109, A: His110, A: Hec116, A: Val22, A: Tyr69, A: Val72, A: His73, A: Cys109, A: His110, A: Hec116, A: Tyr69, A: Val72, A: His73, A: Cys109, A: His110, A: Hec116, A: Val22, A: Tyr69, A: Val72, A: His73, A: Cys109, A: His110, A: Hec116, A: Tyr69, A: Val72, A: His73, A: Ile84, A: Cys109, A: His110, A: Hec116, A: Tyr69, A: Val72, A: His73, A: Ile84, A: His110, A: Hec116, A: Val22, A: Tyr69, A: Val72, A: His73, A: Ile84, A: Cys109, A: His110, A: Hec116, A: Leu20, A: Val22, A: Tyr69, A: Val72, A: His73, A: Ile84, A: Cys109, A: His110, A: Hec116, A: Tyr69, A: Val72, A: His73, A: Cys109, A: His110, A: Hec116, A: Tyr69, A: Val72, A: His73, A: His110, A: Hec116, A: Val22, A: Tyr69, A: Val72, A: His73, A: Cys109, A: His110, A: Hec116, A: Tyr69, A: Val72, A: His73, A: Ile84, A: His110, A: Hec116, A: Val22, A: Tyr69, A: Val72, A: His73, A: Cys109, A: His110, A: Hec116, A: Leu20, A: Tyr69, A: Val72, A: His73, A: Ile84, A: Cys109, A: His110, A: Hec116, A: Leu20, A: Tyr69, A: Val72, A: His73, A: His110, A: Hec116,

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